课程大纲

Fiji和ImageJ的介绍

  • Fiji及其在科学研究中的应用概述
  • 了解ImageJ的架构和插件
  • 安装和设置Fiji以获得最佳性能

基本图像处理技术

  • 图像获取和导入格式
  • 调整对比度、亮度和应用过滤器
  • 图像堆叠和投影方法

进阶Image Analysis

  • 分段技术:阈值化和边缘检测
  • 组织学样本中物体计数和粒子分析
  • 测量区域、周长和其他形态特征

处理Biological样本

  • 处理组织学组织、血细胞和藻类的图像
  • 染色组织的颜色解卷和分析
  • 时隙分析和跟踪细胞运动

自动化和定制

  • 为重复性任务创建和运行宏
  • 使用Fiji插件进行专门分析
  • 使用ImageJ宏语言(IJM)进行基本脚本编写

Data Management和报告

  • 导出结果和生成报告
  • 对图像进行标注并准备数据以供发布
  • 可重复图像分析的最佳实践

总结和结论

要求

  • 生物成像概念的基本了解
  • 熟悉显微镜和组织学技术
  • 基本的计算机使用能力

受众

  • 生物技术和环境毒理学的研究人员
  • 从事组织学和细胞成像的实验室技术人员
  • 对定量图像分析感兴趣的科学家
 14 小时

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