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课程大纲
Fiji与ImageJ简介
- Fiji概述及其在科学研究中的应用。
- 理解ImageJ的架构与插件。
- 安装与配置Fiji以获得最佳性能。
基本图像处理技术
- 图像获取与导入格式。
- 调整对比度、亮度及应用滤镜。
- 图像堆叠与投影方法。
高级图像分析
- 分割技术:阈值化与边缘检测。
- 组织样本中的对象计数与粒子分析。
- 测量面积、周长及其他形态特征。
处理生物样本
- 处理组织切片、血细胞和藻类的图像。
- 染色组织的颜色分离与分析。
- 时间序列分析与细胞运动追踪。
自动化与自定义
- 创建并运行宏以自动化重复性任务。
- 使用Fiji插件进行专业分析。
- 使用ImageJ宏语言(IJM)进行基本脚本编写。
数据管理与报告
- 导出结果并生成报告。
- 图像注释与准备数据以供发表。
- 可重复图像分析的最佳实践。
总结与下一步
要求
- 对生物成像概念有基本了解。
- 熟悉显微镜和组织学技术。
- 具备基本的计算机操作能力。
受众
- 生物技术和环境毒理学领域的研究人员。
- 从事组织学和细胞成像工作的实验室技术人员。
- 对定量图像分析感兴趣的科学家。
14 小时