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课程大纲
Fiji 与 ImageJ 简介
- Fiji 概述及其在科学研究中的应用
- 了解 ImageJ 的架构和插件
- 安装并配置 Fiji 以实现最佳性能
基本图像处理技术
- 图像采集和导入格式
- 调整对比度、亮度及应用滤镜
- 图像堆栈和投影方法
高级图像分析
- 分割技术:阈值化和边缘检测
- 组织学样本中的对象计数和颗粒分析
- 测量面积、周长及其他形态学特征
处理生物样本
- 处理组织学组织、血细胞和藻类图像
- 彩色解卷积及染色组织分析
- 延时分析及细胞运动追踪
自动化与定制
- 创建和运行宏以处理重复性任务
- 使用 Fiji 插件进行专项分析
- 使用 ImageJ 宏语言 (IJM) 进行基础脚本编写
数据管理与报告
- 导出结果并生成报告
- 图像注释及准备出版数据
- 可重复图像分析的最佳实践
要求
- 对生物成像概念有基本了解
- 熟悉显微镜及组织学技术
- 具备基本计算机操作能力
目标受众
- 生物技术与环境毒理学研究人员
- 从事组织学和细胞成像的实验室技术人员
- 对定量图像分析感兴趣的科学家
14 小时