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课程大纲

Fiji 与 ImageJ 简介

  • Fiji 概述及其在科学研究中的应用
  • 了解 ImageJ 的架构和插件
  • 安装并配置 Fiji 以实现最佳性能

基本图像处理技术

  • 图像采集和导入格式
  • 调整对比度、亮度及应用滤镜
  • 图像堆栈和投影方法

高级图像分析

  • 分割技术:阈值化和边缘检测
  • 组织学样本中的对象计数和颗粒分析
  • 测量面积、周长及其他形态学特征

处理生物样本

  • 处理组织学组织、血细胞和藻类图像
  • 彩色解卷积及染色组织分析
  • 延时分析及细胞运动追踪

自动化与定制

  • 创建和运行宏以处理重复性任务
  • 使用 Fiji 插件进行专项分析
  • 使用 ImageJ 宏语言 (IJM) 进行基础脚本编写

数据管理与报告

  • 导出结果并生成报告
  • 图像注释及准备出版数据
  • 可重复图像分析的最佳实践

要求

  • 对生物成像概念有基本了解
  • 熟悉显微镜及组织学技术
  • 具备基本计算机操作能力

目标受众

  • 生物技术与环境毒理学研究人员
  • 从事组织学和细胞成像的实验室技术人员
  • 对定量图像分析感兴趣的科学家
 14 小时

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