课程大纲

Fiji与ImageJ简介

  • Fiji概述及其在科学研究中的应用。
  • 理解ImageJ的架构与插件。
  • 安装与配置Fiji以获得最佳性能。

基本图像处理技术

  • 图像获取与导入格式。
  • 调整对比度、亮度及应用滤镜。
  • 图像堆叠与投影方法。

高级图像分析

  • 分割技术:阈值化与边缘检测。
  • 组织样本中的对象计数与粒子分析。
  • 测量面积、周长及其他形态特征。

处理生物样本

  • 处理组织切片、血细胞和藻类的图像。
  • 染色组织的颜色分离与分析。
  • 时间序列分析与细胞运动追踪。

自动化与自定义

  • 创建并运行宏以自动化重复性任务。
  • 使用Fiji插件进行专业分析。
  • 使用ImageJ宏语言(IJM)进行基本脚本编写。

数据管理与报告

  • 导出结果并生成报告。
  • 图像注释与准备数据以供发表。
  • 可重复图像分析的最佳实践。

总结与下一步

要求

  • 对生物成像概念有基本了解。
  • 熟悉显微镜和组织学技术。
  • 具备基本的计算机操作能力。

受众

  • 生物技术和环境毒理学领域的研究人员。
  • 从事组织学和细胞成像工作的实验室技术人员。
  • 对定量图像分析感兴趣的科学家。
 14 小时

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