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课程大纲
Fiji和ImageJ的介绍
- Fiji及其在科学研究中的应用概述
- 了解ImageJ的架构和插件
- 安装和设置Fiji以获得最佳性能
基本图像处理技术
- 图像获取和导入格式
- 调整对比度、亮度和应用过滤器
- 图像堆叠和投影方法
进阶Image Analysis
- 分段技术:阈值化和边缘检测
- 组织学样本中物体计数和粒子分析
- 测量区域、周长和其他形态特征
处理Biological样本
- 处理组织学组织、血细胞和藻类的图像
- 染色组织的颜色解卷和分析
- 时隙分析和跟踪细胞运动
自动化和定制
- 为重复性任务创建和运行宏
- 使用Fiji插件进行专门分析
- 使用ImageJ宏语言(IJM)进行基本脚本编写
Data Management和报告
- 导出结果和生成报告
- 对图像进行标注并准备数据以供发布
- 可重复图像分析的最佳实践
总结和结论
要求
- 生物成像概念的基本了解
- 熟悉显微镜和组织学技术
- 基本的计算机使用能力
受众
- 生物技术和环境毒理学的研究人员
- 从事组织学和细胞成像的实验室技术人员
- 对定量图像分析感兴趣的科学家
14 小时