江苏省微生物基因组学（Microbial Genomics）培训

微生物基因组学和宏基因组学结合测序技术和计算分析，以分析微生物群落、表征基因组，并检测功能特性，如抗微生物耐药性。

本次由讲师指导的培训（线上或线下）面向初学者到中级水平的研究人员和生物信息学家，他们希望进行微生物基因组学和宏基因组测序数据的实际操作分析。

通过本次培训，参与者将能够：

• 描述微生物基因组学中常见的测序工作流程和关键文件格式。
• 对原始NGS读段进行质量控制和预处理。
• 使用基于标记和k-mer方法进行物种分类分析。
• 组装和注释微生物基因组和质粒。
• 检测SNP，构建系统发育树并解释种群结构。
• 预测抗微生物耐药性基因并总结功能特征。
• 使用Conda、Docker和基于笔记本的报告实现可重复的工作流程。

课程形式

• 介绍概念和工具的讲座（20%）。
• 使用示例数据集进行实际操作（60%）。
• 开放式讨论和指导分析，使参与者能够将方法应用于自己的数据（20%）。

课程定制选项

• 如需定制专注于临床、环境或工业宏基因组学的研讨会，请联系我们安排。